Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA5P20719 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms