Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP4AP20648 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms