Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL3P19876 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms