Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2CP19387 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms