Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT4P19013 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT4P19013 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT4P19013 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT4P19013 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT4P19013 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT4P19013 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT4P19013 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT4P19013 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms