Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRAP18433 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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