Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOT1P17174 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOT1P17174 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOT1P17174 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOT1P17174 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GOT1P17174 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOT1P17174 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOT1P17174 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOT1P17174 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOT1P17174 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOT1P17174 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOT1P17174 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOT1P17174 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOT1P17174 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOT1P17174 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOT1P17174 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOT1P17174 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOT1P17174 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOT1P17174 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOT1P17174 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOT1P17174 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOT1P17174 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOT1P17174 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOT1P17174 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms