Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2A2P16615 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms