Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB3P16520 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNB3P16520 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNB3P16520 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNB3P16520 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB3P16520 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB3P16520 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB3P16520 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB3P16520 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB3P16520 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB3P16520 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB3P16520 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB3P16520 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB3P16520 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB3P16520 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB3P16520 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB3P16520 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB3P16520 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB3P16520 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB3P16520 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB3P16520 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB3P16520 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB3P16520 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB3P16520 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms