Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGB4P16144 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB4P16144 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB4P16144 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGB4P16144 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB4P16144 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB4P16144 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB4P16144 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ITGB4P16144 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGB4P16144 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms