Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA1P15976 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA1P15976 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA1P15976 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA1P15976 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA1P15976 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA1P15976 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA1P15976 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA1P15976 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms