Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB2P14652 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB2P14652 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB2P14652 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB2P14652 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms