Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RARGP13631 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RARGP13631 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARGP13631 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARGP13631 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARGP13631 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARGP13631 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARGP13631 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARGP13631 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARGP13631 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARGP13631 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARGP13631 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARGP13631 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARGP13631 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARGP13631 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARGP13631 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RARGP13631 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RARGP13631 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RARGP13631 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms