Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL6A2P12110 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms