Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCL3P10147 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCL3P10147 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCL3P10147 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3P10147 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3P10147 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3P10147 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCL3P10147 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCL3P10147 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCL3P10147 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCL3P10147 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCL3P10147 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3P10147 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3P10147 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3P10147 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3P10147 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3P10147 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3P10147 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3P10147 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3P10147 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3P10147 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms