Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HKR1P10072 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HKR1P10072 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HKR1P10072 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HKR1P10072 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HKR1P10072 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HKR1P10072 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HKR1P10072 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HKR1P10072 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HKR1P10072 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms