Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GLI3P10071 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI3P10071 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI3P10071 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI3P10071 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI3P10071 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI3P10071 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI3P10071 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI3P10071 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI3P10071 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI3P10071 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI3P10071 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GLI3P10071 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI3P10071 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI3P10071 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI3P10071 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI3P10071 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI3P10071 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI3P10071 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI3P10071 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI3P10071 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI3P10071 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI3P10071 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms