Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAA2P0DJI9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms