Protein–RNA interactions for Protein: P0CG33

GOLGA6D, Golgin subfamily A member 6D, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6DP0CG33 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6DP0CG33 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6DP0CG33 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms