Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NHLRC4P0CG21 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NHLRC4P0CG21 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms