Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CT47B1P0C2W7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CT47B1P0C2W7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms