Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4AP0C0L4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms