Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI1P08151 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI1P08151 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI1P08151 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI1P08151 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms