Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM2P07951 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM2P07951 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TPM2P07951 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TPM2P07951 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM2P07951 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM2P07951 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM2P07951 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms