Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALB1P05937 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALB1P05937 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALB1P05937 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALB1P05937 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALB1P05937 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALB1P05937 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB1P05937 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB1P05937 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB1P05937 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB1P05937 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALB1P05937 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALB1P05937 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALB1P05937 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALB1P05937 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms