Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLEC3BP05452 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLEC3BP05452 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms