Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms