Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGGP02679 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGGP02679 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGGP02679 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FGGP02679 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGGP02679 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGGP02679 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGGP02679 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGGP02679 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGGP02679 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGGP02679 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGGP02679 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGGP02679 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGGP02679 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGGP02679 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGGP02679 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms