Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms