Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CST3P01034 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CST3P01034 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST3P01034 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST3P01034 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST3P01034 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST3P01034 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST3P01034 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST3P01034 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST3P01034 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST3P01034 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CST3P01034 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CST3P01034 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CST3P01034 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST3P01034 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST3P01034 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST3P01034 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST3P01034 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CST3P01034 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CST3P01034 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CST3P01034 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms