Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX18O95935 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX18O95935 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX18O95935 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX18O95935 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX18O95935 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TBX18O95935 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TBX18O95935 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TBX18O95935 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX18O95935 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX18O95935 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX18O95935 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX18O95935 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX18O95935 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX18O95935 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX18O95935 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX18O95935 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX18O95935 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX18O95935 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX18O95935 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX18O95935 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX18O95935 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX18O95935 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX18O95935 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms