Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYF2O95926 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYF2O95926 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYF2O95926 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYF2O95926 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYF2O95926 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYF2O95926 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYF2O95926 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYF2O95926 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYF2O95926 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYF2O95926 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms