Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms