Protein–RNA interactions for Protein: O76090

BEST1, Bestrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST1O76090 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST1O76090 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST1O76090 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST1O76090 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST1O76090 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST1O76090 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST1O76090 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST1O76090 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST1O76090 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST1O76090 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST1O76090 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST1O76090 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST1O76090 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST1O76090 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST1O76090 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST1O76090 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST1O76090 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST1O76090 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST1O76090 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST1O76090 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST1O76090 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST1O76090 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST1O76090 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST1O76090 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST1O76090 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST1O76090 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms