Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIOO75962 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIOO75962 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIOO75962 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIOO75962 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIOO75962 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIOO75962 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIOO75962 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIOO75962 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIOO75962 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIOO75962 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIOO75962 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIOO75962 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIOO75962 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIOO75962 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIOO75962 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIOO75962 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIOO75962 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIOO75962 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms