Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX3O75364 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PITX3O75364 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX3O75364 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms