Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45BO75293 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45BO75293 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms