Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3BO75182 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms