Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG13O75143 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG13O75143 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG13O75143 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG13O75143 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG13O75143 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG13O75143 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG13O75143 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG13O75143 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG13O75143 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG13O75143 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG13O75143 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG13O75143 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms