Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms