Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPX2O60687 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPX2O60687 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms