Protein–RNA interactions for Protein: O60543

CIDEA, Cell death activator CIDE-A, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEAO60543 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIDEAO60543 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms