Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms