Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRC1O43663 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRC1O43663 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRC1O43663 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRC1O43663 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRC1O43663 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRC1O43663 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRC1O43663 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRC1O43663 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRC1O43663 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRC1O43663 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRC1O43663 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRC1O43663 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRC1O43663 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRC1O43663 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRC1O43663 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRC1O43663 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms