Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51CO43502 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms