Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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