Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF1O43189 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF1O43189 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF1O43189 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF1O43189 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF1O43189 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF1O43189 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF1O43189 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF1O43189 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms