Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM6AO15550 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KDM6AO15550 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM6AO15550 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6AO15550 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6AO15550 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6AO15550 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6AO15550 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6AO15550 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6AO15550 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6AO15550 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms