Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS1O15524 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOCS1O15524 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms