Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUPL2O15504 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms